MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoplanus petrolearius DSM 11571 chromosome

Total Repeats: 51250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014507	TTC	2	6	485	490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
2	NC_014507	CGG	2	6	515	520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352169
3	NC_014507	ATA	2	6	541	546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352169
4	NC_014507	CA	3	6	583	588	50 %	0 %	0 %	50 %	307352169
5	NC_014507	AGATC	2	10	614	623	40 %	20 %	20 %	20 %	307352169
6	NC_014507	GAAAC	2	10	658	667	60 %	0 %	20 %	20 %	307352169
7	NC_014507	AC	3	6	808	813	50 %	0 %	0 %	50 %	307352169
8	NC_014507	ACA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
9	NC_014507	TTG	2	6	943	948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352169
10	NC_014507	A	6	6	1001	1006	100 %	0 %	0 %	0 %	307352169
11	NC_014507	TCC	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
12	NC_014507	GAA	3	9	1143	1151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
13	NC_014507	TCC	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352169
14	NC_014507	TGA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352169
15	NC_014507	CAG	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352169
16	NC_014507	CTT	2	6	1467	1472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352169
17	NC_014507	CAA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352169
18	NC_014507	GATC	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	307352169
19	NC_014507	GAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352169
20	NC_014507	AGGA	2	8	1943	1950	50 %	0 %	50 %	0 %	307352170
21	NC_014507	AGGA	2	8	1979	1986	50 %	0 %	50 %	0 %	307352170
22	NC_014507	GA	4	8	2074	2081	50 %	0 %	50 %	0 %	307352170
23	NC_014507	CAC	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352170
24	NC_014507	TCG	3	9	2174	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352170
25	NC_014507	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352170
26	NC_014507	A	8	8	2306	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	307352170
27	NC_014507	GA	3	6	2358	2363	50 %	0 %	50 %	0 %	307352171
28	NC_014507	TTCG	2	8	2366	2373	0 %	50 %	25 %	25 %	307352171
29	NC_014507	GGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
30	NC_014507	TCGA	2	8	2512	2519	25 %	25 %	25 %	25 %	307352171
31	NC_014507	ACT	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
32	NC_014507	GAA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352171
33	NC_014507	AT	3	6	2721	2726	50 %	50 %	0 %	0 %	307352171
34	NC_014507	TTC	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352171
35	NC_014507	AAC	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352171
36	NC_014507	TGA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352171
37	NC_014507	ATC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
38	NC_014507	AT	3	6	2962	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	307352171
39	NC_014507	CCG	2	6	2999	3004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
40	NC_014507	TG	3	6	3092	3097	0 %	50 %	50 %	0 %	307352171
41	NC_014507	GGA	2	6	3102	3107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352171
42	NC_014507	TGCAG	2	10	3112	3121	20 %	20 %	40 %	20 %	307352171
43	NC_014507	TCA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
44	NC_014507	CGC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352171
45	NC_014507	CCTGC	2	10	3279	3288	0 %	20 %	20 %	60 %	307352171
46	NC_014507	CAT	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352171
47	NC_014507	TGT	2	6	3390	3395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352171
48	NC_014507	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352171
49	NC_014507	ATA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
50	NC_014507	TCT	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352172
51	NC_014507	GCA	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
52	NC_014507	CCG	2	6	4062	4067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
53	NC_014507	TAC	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
54	NC_014507	CAG	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
55	NC_014507	GCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
56	NC_014507	CCG	2	6	4127	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
57	NC_014507	GT	3	6	4158	4163	0 %	50 %	50 %	0 %	307352172
58	NC_014507	GTC	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
59	NC_014507	TACA	2	8	4255	4262	50 %	25 %	0 %	25 %	307352172
60	NC_014507	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
61	NC_014507	CTC	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
62	NC_014507	TCC	2	6	4532	4537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
63	NC_014507	ATA	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352172
64	NC_014507	TCC	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
65	NC_014507	TCC	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
66	NC_014507	AGA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
67	NC_014507	GTA	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
68	NC_014507	GAA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
69	NC_014507	GATC	2	8	5074	5081	25 %	25 %	25 %	25 %	307352172
70	NC_014507	GAC	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
71	NC_014507	TGA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
72	NC_014507	TGA	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
73	NC_014507	TC	3	6	5253	5258	0 %	50 %	0 %	50 %	307352172
74	NC_014507	AT	3	6	5288	5293	50 %	50 %	0 %	0 %	307352172
75	NC_014507	TCA	2	6	5364	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352172
76	NC_014507	GGTG	2	8	5397	5404	0 %	25 %	75 %	0 %	307352172
77	NC_014507	GGA	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
78	NC_014507	CGT	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
79	NC_014507	GTA	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
80	NC_014507	GCC	2	6	5571	5576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352172
81	NC_014507	CGG	2	6	5598	5603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
82	NC_014507	TGT	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352172
83	NC_014507	GAG	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
84	NC_014507	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
85	NC_014507	TC	3	6	5851	5856	0 %	50 %	0 %	50 %	307352172
86	NC_014507	AGA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
87	NC_014507	AGA	2	6	6023	6028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
88	NC_014507	AGG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352172
89	NC_014507	CTTC	2	8	6141	6148	0 %	50 %	0 %	50 %	307352172
90	NC_014507	AAGG	2	8	6225	6232	50 %	0 %	50 %	0 %	307352172
91	NC_014507	AT	3	6	6237	6242	50 %	50 %	0 %	0 %	307352172
92	NC_014507	AT	3	6	6299	6304	50 %	50 %	0 %	0 %	307352172
93	NC_014507	GAC	2	6	6326	6331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
94	NC_014507	GGC	2	6	6340	6345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352172
95	NC_014507	C	6	6	6410	6415	0 %	0 %	0 %	100 %	307352172
96	NC_014507	GAA	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352172
97	NC_014507	AGC	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
98	NC_014507	ATT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352172
99	NC_014507	CCT	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352172
100	NC_014507	GAACCA	2	12	6544	6555	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	307352172
101	NC_014507	ATG	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352172
102	NC_014507	AGC	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352172
103	NC_014507	GCT	3	9	6611	6619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352172
104	NC_014507	GAA	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352173
105	NC_014507	T	6	6	6807	6812	0 %	100 %	0 %	0 %	307352173
106	NC_014507	CCT	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
107	NC_014507	TTG	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352173
108	NC_014507	CGG	2	6	7181	7186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352173
109	NC_014507	GAT	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352173
110	NC_014507	TCC	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352173
111	NC_014507	GGA	2	6	7349	7354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352173
112	NC_014507	TCT	2	6	7361	7366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352173
113	NC_014507	CGA	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352173
114	NC_014507	GTG	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352173
115	NC_014507	TGTA	2	8	7501	7508	25 %	50 %	25 %	0 %	307352173
116	NC_014507	AGGC	2	8	7511	7518	25 %	0 %	50 %	25 %	307352173
117	NC_014507	A	6	6	7652	7657	100 %	0 %	0 %	0 %	307352174
118	NC_014507	TCGAT	2	10	7693	7702	20 %	40 %	20 %	20 %	307352174
119	NC_014507	GAT	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
120	NC_014507	GAT	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
121	NC_014507	GTT	2	6	7856	7861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352174
122	NC_014507	GGC	2	6	7877	7882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352174
123	NC_014507	GCC	2	6	7900	7905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352174
124	NC_014507	TCC	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352174
125	NC_014507	GAC	2	6	7982	7987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352174
126	NC_014507	ATTTT	2	10	8056	8065	20 %	80 %	0 %	0 %	307352174
127	NC_014507	GAT	2	6	8243	8248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
128	NC_014507	TTC	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352174
129	NC_014507	TC	3	6	8300	8305	0 %	50 %	0 %	50 %	307352174
130	NC_014507	TGC	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352174
131	NC_014507	TGA	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352174
132	NC_014507	AGA	2	6	8392	8397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352174
133	NC_014507	A	6	6	8416	8421	100 %	0 %	0 %	0 %	307352174
134	NC_014507	GA	3	6	8422	8427	50 %	0 %	50 %	0 %	307352174
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263	NC_014507	CGA	2	6	15880	15885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352183
264	NC_014507	CCT	2	6	15926	15931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352183
265	NC_014507	GAG	2	6	15935	15940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352183
266	NC_014507	CTC	2	6	15999	16004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352183
267	NC_014507	GTG	2	6	16070	16075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307352183
268	NC_014507	CAG	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352183
269	NC_014507	GTC	2	6	16101	16106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352183
270	NC_014507	ATT	2	6	16137	16142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352183
271	NC_014507	AATTC	2	10	16200	16209	40 %	40 %	0 %	20 %	307352183
272	NC_014507	ATC	2	6	16224	16229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352183
273	NC_014507	CAG	2	6	16246	16251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352184
274	NC_014507	GGA	2	6	16299	16304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352184
275	NC_014507	CCG	2	6	16358	16363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352184
276	NC_014507	TTC	2	6	16410	16415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352184
277	NC_014507	CGA	2	6	16440	16445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352184
278	NC_014507	AGGA	2	8	16460	16467	50 %	0 %	50 %	0 %	307352184
279	NC_014507	CAA	2	6	16494	16499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352184
280	NC_014507	CGA	2	6	16506	16511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352184
281	NC_014507	CT	3	6	16518	16523	0 %	50 %	0 %	50 %	307352184
282	NC_014507	TCG	2	6	16553	16558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352184
283	NC_014507	AGA	2	6	16811	16816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307352184
284	NC_014507	ATC	2	6	16835	16840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307352184
285	NC_014507	ATT	2	6	16856	16861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352184
286	NC_014507	TGC	2	6	16957	16962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352184
287	NC_014507	GAT	2	6	17095	17100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352184
288	NC_014507	AGG	2	6	17195	17200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352184
289	NC_014507	AGG	2	6	17207	17212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352184
290	NC_014507	ATG	2	6	17225	17230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352184
291	NC_014507	TCT	2	6	17238	17243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352184
292	NC_014507	CTG	2	6	17255	17260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352184
293	NC_014507	CCG	2	6	17279	17284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307352184
294	NC_014507	CCA	2	6	17298	17303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307352184
295	NC_014507	TCG	2	6	17368	17373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352185
296	NC_014507	GTA	2	6	17508	17513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307352185
297	NC_014507	GTCT	2	8	17577	17584	0 %	50 %	25 %	25 %	307352185
298	NC_014507	TAT	2	6	17658	17663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352185
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300	NC_014507	TCT	2	6	17818	17823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352185
301	NC_014507	TGC	2	6	17858	17863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352185
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303	NC_014507	TCG	2	6	18013	18018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352185
304	NC_014507	GGATT	2	10	18037	18046	20 %	40 %	40 %	0 %	307352185
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322	NC_014507	TA	3	6	19314	19319	50 %	50 %	0 %	0 %	307352186
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332	NC_014507	CTG	2	6	19877	19882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352186
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340	NC_014507	AAT	2	6	20470	20475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307352187
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368	NC_014507	CCTG	2	8	22694	22701	0 %	25 %	25 %	50 %	307352188
369	NC_014507	TC	3	6	22703	22708	0 %	50 %	0 %	50 %	307352188
370	NC_014507	AG	3	6	22736	22741	50 %	0 %	50 %	0 %	307352188
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381	NC_014507	T	6	6	23282	23287	0 %	100 %	0 %	0 %	307352189
382	NC_014507	ATT	2	6	23360	23365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307352189
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384	NC_014507	CA	3	6	23502	23507	50 %	0 %	0 %	50 %	307352189
385	NC_014507	GA	3	6	23524	23529	50 %	0 %	50 %	0 %	307352189
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387	NC_014507	GA	3	6	23612	23617	50 %	0 %	50 %	0 %	307352189
388	NC_014507	CGG	2	6	23645	23650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307352189
389	NC_014507	ACA	2	6	23654	23659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352189
390	NC_014507	TCT	2	6	23710	23715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307352189
391	NC_014507	TTG	2	6	23855	23860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307352189
392	NC_014507	GTC	2	6	23905	23910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352189
393	NC_014507	ACGG	2	8	23926	23933	25 %	0 %	50 %	25 %	307352189
394	NC_014507	CGA	2	6	24018	24023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307352189
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396	NC_014507	CAA	2	6	24078	24083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307352189
397	NC_014507	AGG	2	6	24149	24154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352189
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399	NC_014507	TCG	2	6	24276	24281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307352190
400	NC_014507	GGA	2	6	24282	24287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352190
401	NC_014507	GCGGGA	2	12	24288	24299	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	307352190
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411	NC_014507	CTC	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307352190
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425	NC_014507	GAG	2	6	25281	25286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307352191
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433	NC_014507	GA	4	8	25704	25711	50 %	0 %	50 %	0 %	307352191
434	NC_014507	AGGA	2	8	25741	25748	50 %	0 %	50 %	0 %	307352191
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